Nataša Govekar studierte Slowenische Sprache und Literatur sowie Theologie an der Universität von Ljubljana und promovierte in Missiologie an der Päpstlichen Universität Gregoriana mit einer Dissertation über die Kommunikation des Glaubens durch Bilder. 

Sie beschäftigt sich mit der Beziehung zwischen Kunst und Glaube sowie mit den Methoden der spirituellen Kommunikation durch Kunst und symbolische Sprache. 

Im Februar 2016 ernannte Papst Franziskus Nataša Govekar zur Direktorin der theologisch-pastoralen Abteilung des Dikasteriums für Kommunikation. Ende 2020 startete ihre Abteilung das Projekt „Faith Communication in the Digital Word“, das junge Digitalexperten in die Entwicklung von Richtlinien und Werkzeugen für die pastorale Online-Kommunikation einbezieht.